Protein–RNA interactions for Protein: P08572

COL4A2, Collagen alpha-2(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A2P08572 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A2P08572 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A2P08572 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A2P08572 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms