Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB1P05556 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB1P05556 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms