Protein–RNA interactions for Protein: P02747

C1QC, Complement C1q subcomponent subunit C, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QCP02747 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QCP02747 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QCP02747 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QCP02747 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QCP02747 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QCP02747 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QCP02747 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QCP02747 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QCP02747 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QCP02747 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QCP02747 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QCP02747 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QCP02747 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QCP02747 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QCP02747 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QCP02747 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QCP02747 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QCP02747 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QCP02747 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QCP02747 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QCP02747 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QCP02747 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QCP02747 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QCP02747 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QCP02747 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QCP02747 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QCP02747 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QCP02747 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QCP02747 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QCP02747 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QCP02747 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QCP02747 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QCP02747 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QCP02747 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QCP02747 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QCP02747 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QCP02747 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QCP02747 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QCP02747 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QCP02747 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QCP02747 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QCP02747 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QCP02747 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QCP02747 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QCP02747 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QCP02747 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QCP02747 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QCP02747 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QCP02747 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QCP02747 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QCP02747 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QCP02747 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QCP02747 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QCP02747 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QCP02747 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QCP02747 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QCP02747 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QCP02747 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QCP02747 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QCP02747 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QCP02747 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QCP02747 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QCP02747 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QCP02747 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QCP02747 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QCP02747 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QCP02747 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QCP02747 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QCP02747 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QCP02747 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QCP02747 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QCP02747 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QCP02747 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QCP02747 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QCP02747 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QCP02747 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QCP02747 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QCP02747 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QCP02747 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QCP02747 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QCP02747 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QCP02747 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QCP02747 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QCP02747 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QCP02747 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QCP02747 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QCP02747 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QCP02747 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QCP02747 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QCP02747 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QCP02747 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QCP02747 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QCP02747 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QCP02747 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QCP02747 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QCP02747 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QCP02747 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QCP02747 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QCP02747 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QCP02747 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms