Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOA2P02652 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOA2P02652 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOA2P02652 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOA2P02652 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOA2P02652 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOA2P02652 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOA2P02652 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOA2P02652 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOA2P02652 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOA2P02652 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOA2P02652 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
APOA2P02652 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOA2P02652 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOA2P02652 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOA2P02652 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOA2P02652 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOA2P02652 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOA2P02652 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOA2P02652 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOA2P02652 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOA2P02652 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOA2P02652 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOA2P02652 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOA2P02652 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOA2P02652 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOA2P02652 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOA2P02652 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOA2P02652 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOA2P02652 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOA2P02652 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOA2P02652 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
APOA2P02652 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOA2P02652 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOA2P02652 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA2P02652 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA2P02652 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA2P02652 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA2P02652 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA2P02652 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA2P02652 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA2P02652 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA2P02652 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA2P02652 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA2P02652 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA2P02652 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA2P02652 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA2P02652 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA2P02652 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA2P02652 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA2P02652 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA2P02652 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA2P02652 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA2P02652 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA2P02652 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA2P02652 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA2P02652 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA2P02652 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA2P02652 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA2P02652 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA2P02652 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA2P02652 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA2P02652 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA2P02652 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA2P02652 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA2P02652 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA2P02652 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA2P02652 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA2P02652 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA2P02652 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA2P02652 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA2P02652 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA2P02652 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA2P02652 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA2P02652 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA2P02652 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA2P02652 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA2P02652 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA2P02652 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA2P02652 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA2P02652 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA2P02652 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA2P02652 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA2P02652 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA2P02652 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA2P02652 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA2P02652 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA2P02652 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA2P02652 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA2P02652 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA2P02652 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA2P02652 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA2P02652 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA2P02652 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA2P02652 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA2P02652 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA2P02652 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA2P02652 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA2P02652 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA2P02652 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms