Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFP01133 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFP01133 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFP01133 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFP01133 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFP01133 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFP01133 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFP01133 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFP01133 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFP01133 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFP01133 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFP01133 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFP01133 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFP01133 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFP01133 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFP01133 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFP01133 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFP01133 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFP01133 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFP01133 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFP01133 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFP01133 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFP01133 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFP01133 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFP01133 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFP01133 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EGFP01133 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFP01133 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFP01133 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFP01133 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFP01133 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFP01133 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFP01133 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFP01133 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFP01133 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFP01133 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFP01133 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFP01133 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFP01133 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFP01133 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFP01133 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFP01133 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFP01133 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFP01133 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFP01133 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFP01133 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFP01133 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFP01133 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFP01133 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFP01133 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFP01133 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFP01133 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFP01133 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFP01133 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFP01133 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFP01133 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFP01133 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFP01133 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFP01133 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFP01133 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFP01133 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFP01133 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFP01133 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EGFP01133 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EGFP01133 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EGFP01133 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFP01133 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFP01133 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFP01133 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFP01133 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFP01133 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFP01133 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFP01133 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFP01133 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFP01133 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFP01133 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFP01133 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFP01133 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFP01133 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFP01133 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFP01133 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFP01133 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFP01133 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFP01133 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFP01133 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFP01133 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFP01133 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFP01133 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFP01133 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFP01133 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFP01133 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFP01133 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFP01133 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFP01133 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFP01133 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFP01133 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFP01133 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFP01133 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFP01133 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFP01133 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms