Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX7O95931 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX7O95931 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX7O95931 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX7O95931 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX7O95931 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX7O95931 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX7O95931 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX7O95931 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX7O95931 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX7O95931 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX7O95931 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX7O95931 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX7O95931 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX7O95931 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX7O95931 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX7O95931 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CBX7O95931 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBX7O95931 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBX7O95931 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX7O95931 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX7O95931 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX7O95931 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX7O95931 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX7O95931 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX7O95931 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX7O95931 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX7O95931 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX7O95931 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX7O95931 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX7O95931 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX7O95931 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX7O95931 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX7O95931 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX7O95931 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX7O95931 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX7O95931 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX7O95931 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX7O95931 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX7O95931 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX7O95931 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX7O95931 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX7O95931 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX7O95931 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX7O95931 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX7O95931 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX7O95931 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX7O95931 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX7O95931 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX7O95931 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX7O95931 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX7O95931 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX7O95931 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX7O95931 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX7O95931 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX7O95931 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX7O95931 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX7O95931 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX7O95931 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX7O95931 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX7O95931 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX7O95931 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX7O95931 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX7O95931 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX7O95931 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX7O95931 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX7O95931 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX7O95931 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX7O95931 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX7O95931 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX7O95931 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX7O95931 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX7O95931 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX7O95931 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX7O95931 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX7O95931 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX7O95931 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX7O95931 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX7O95931 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX7O95931 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX7O95931 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX7O95931 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX7O95931 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX7O95931 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX7O95931 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX7O95931 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX7O95931 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX7O95931 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX7O95931 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX7O95931 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX7O95931 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX7O95931 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX7O95931 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX7O95931 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX7O95931 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX7O95931 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX7O95931 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX7O95931 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX7O95931 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX7O95931 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms