Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MATN4O95460 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MATN4O95460 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MATN4O95460 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MATN4O95460 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MATN4O95460 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MATN4O95460 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MATN4O95460 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MATN4O95460 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MATN4O95460 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MATN4O95460 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MATN4O95460 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MATN4O95460 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MATN4O95460 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MATN4O95460 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MATN4O95460 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MATN4O95460 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MATN4O95460 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MATN4O95460 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MATN4O95460 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MATN4O95460 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MATN4O95460 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MATN4O95460 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MATN4O95460 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MATN4O95460 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MATN4O95460 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MATN4O95460 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MATN4O95460 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MATN4O95460 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MATN4O95460 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MATN4O95460 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MATN4O95460 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MATN4O95460 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MATN4O95460 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MATN4O95460 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MATN4O95460 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MATN4O95460 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MATN4O95460 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MATN4O95460 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MATN4O95460 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MATN4O95460 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MATN4O95460 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MATN4O95460 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MATN4O95460 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MATN4O95460 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MATN4O95460 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MATN4O95460 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MATN4O95460 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MATN4O95460 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MATN4O95460 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MATN4O95460 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MATN4O95460 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MATN4O95460 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MATN4O95460 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MATN4O95460 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MATN4O95460 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MATN4O95460 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MATN4O95460 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MATN4O95460 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MATN4O95460 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MATN4O95460 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MATN4O95460 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MATN4O95460 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MATN4O95460 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MATN4O95460 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MATN4O95460 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MATN4O95460 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MATN4O95460 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MATN4O95460 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MATN4O95460 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MATN4O95460 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MATN4O95460 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MATN4O95460 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MATN4O95460 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MATN4O95460 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MATN4O95460 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MATN4O95460 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MATN4O95460 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MATN4O95460 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MATN4O95460 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN4O95460 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN4O95460 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN4O95460 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN4O95460 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN4O95460 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN4O95460 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN4O95460 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN4O95460 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN4O95460 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MATN4O95460 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MATN4O95460 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MATN4O95460 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MATN4O95460 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MATN4O95460 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MATN4O95460 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MATN4O95460 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MATN4O95460 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MATN4O95460 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MATN4O95460 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MATN4O95460 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms