Protein–RNA interactions for Protein: O95257

GADD45G, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GO95257 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GO95257 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GO95257 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GO95257 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GO95257 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GO95257 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GO95257 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GO95257 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GO95257 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GO95257 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GO95257 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45GO95257 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GO95257 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms