Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE4BO95155 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4BO95155 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBE4BO95155 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms