Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIG2O94898 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG2O94898 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms