Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UFL1O94874 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UFL1O94874 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UFL1O94874 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UFL1O94874 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UFL1O94874 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UFL1O94874 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UFL1O94874 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UFL1O94874 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UFL1O94874 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UFL1O94874 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UFL1O94874 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UFL1O94874 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UFL1O94874 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UFL1O94874 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
UFL1O94874 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UFL1O94874 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UFL1O94874 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UFL1O94874 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UFL1O94874 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UFL1O94874 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UFL1O94874 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UFL1O94874 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UFL1O94874 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
UFL1O94874 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UFL1O94874 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UFL1O94874 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UFL1O94874 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UFL1O94874 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
UFL1O94874 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UFL1O94874 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UFL1O94874 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UFL1O94874 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UFL1O94874 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UFL1O94874 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UFL1O94874 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UFL1O94874 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UFL1O94874 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UFL1O94874 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UFL1O94874 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
UFL1O94874 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
UFL1O94874 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UFL1O94874 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UFL1O94874 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UFL1O94874 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UFL1O94874 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UFL1O94874 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UFL1O94874 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UFL1O94874 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UFL1O94874 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UFL1O94874 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UFL1O94874 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UFL1O94874 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UFL1O94874 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UFL1O94874 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UFL1O94874 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UFL1O94874 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UFL1O94874 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UFL1O94874 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UFL1O94874 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UFL1O94874 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UFL1O94874 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UFL1O94874 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UFL1O94874 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
UFL1O94874 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UFL1O94874 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UFL1O94874 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UFL1O94874 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UFL1O94874 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UFL1O94874 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UFL1O94874 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UFL1O94874 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UFL1O94874 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UFL1O94874 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UFL1O94874 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UFL1O94874 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UFL1O94874 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UFL1O94874 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UFL1O94874 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UFL1O94874 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UFL1O94874 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UFL1O94874 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UFL1O94874 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UFL1O94874 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UFL1O94874 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UFL1O94874 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UFL1O94874 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
UFL1O94874 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UFL1O94874 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UFL1O94874 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
UFL1O94874 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UFL1O94874 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UFL1O94874 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UFL1O94874 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UFL1O94874 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UFL1O94874 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UFL1O94874 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UFL1O94874 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UFL1O94874 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UFL1O94874 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms