Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK2AP2O75956 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK2AP2O75956 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms