Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1BO75688 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPM1BO75688 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms