Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH16O75452 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH16O75452 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH16O75452 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH16O75452 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH16O75452 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH16O75452 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH16O75452 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH16O75452 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH16O75452 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH16O75452 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH16O75452 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH16O75452 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH16O75452 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH16O75452 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH16O75452 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH16O75452 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH16O75452 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH16O75452 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH16O75452 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH16O75452 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH16O75452 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH16O75452 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH16O75452 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH16O75452 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH16O75452 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH16O75452 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH16O75452 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH16O75452 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH16O75452 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH16O75452 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH16O75452 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH16O75452 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH16O75452 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH16O75452 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDH16O75452 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH16O75452 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH16O75452 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH16O75452 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH16O75452 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH16O75452 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH16O75452 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH16O75452 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH16O75452 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH16O75452 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH16O75452 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH16O75452 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH16O75452 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH16O75452 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH16O75452 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH16O75452 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH16O75452 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH16O75452 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH16O75452 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH16O75452 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH16O75452 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH16O75452 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH16O75452 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH16O75452 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH16O75452 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH16O75452 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH16O75452 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH16O75452 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH16O75452 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH16O75452 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH16O75452 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH16O75452 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH16O75452 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH16O75452 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH16O75452 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH16O75452 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH16O75452 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH16O75452 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH16O75452 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH16O75452 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH16O75452 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH16O75452 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH16O75452 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH16O75452 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH16O75452 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH16O75452 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH16O75452 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH16O75452 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH16O75452 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH16O75452 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH16O75452 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH16O75452 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH16O75452 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH16O75452 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH16O75452 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH16O75452 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH16O75452 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH16O75452 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH16O75452 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH16O75452 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH16O75452 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH16O75452 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH16O75452 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH16O75452 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH16O75452 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms