Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF40O75150 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF40O75150 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF40O75150 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF40O75150 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF40O75150 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF40O75150 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF40O75150 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF40O75150 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF40O75150 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF40O75150 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF40O75150 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF40O75150 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF40O75150 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF40O75150 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF40O75150 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF40O75150 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNF40O75150 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF40O75150 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF40O75150 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF40O75150 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF40O75150 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF40O75150 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF40O75150 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF40O75150 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF40O75150 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF40O75150 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF40O75150 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF40O75150 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF40O75150 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF40O75150 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF40O75150 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF40O75150 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF40O75150 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF40O75150 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF40O75150 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF40O75150 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF40O75150 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF40O75150 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF40O75150 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF40O75150 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF40O75150 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF40O75150 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF40O75150 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF40O75150 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF40O75150 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF40O75150 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF40O75150 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF40O75150 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF40O75150 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF40O75150 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF40O75150 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF40O75150 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF40O75150 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF40O75150 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF40O75150 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF40O75150 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF40O75150 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF40O75150 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF40O75150 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF40O75150 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RNF40O75150 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF40O75150 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF40O75150 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF40O75150 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF40O75150 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF40O75150 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF40O75150 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF40O75150 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF40O75150 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF40O75150 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF40O75150 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF40O75150 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF40O75150 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF40O75150 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF40O75150 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF40O75150 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF40O75150 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF40O75150 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF40O75150 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF40O75150 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF40O75150 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF40O75150 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF40O75150 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF40O75150 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF40O75150 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF40O75150 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF40O75150 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF40O75150 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF40O75150 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF40O75150 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF40O75150 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF40O75150 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF40O75150 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF40O75150 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF40O75150 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF40O75150 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF40O75150 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF40O75150 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF40O75150 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms