Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED4O75132 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZBED4O75132 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZBED4O75132 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBED4O75132 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms