Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGSF3O75054 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IGSF3O75054 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
IGSF3O75054 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms