Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DTNBO60941 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DTNBO60941 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DTNBO60941 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DTNBO60941 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DTNBO60941 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DTNBO60941 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DTNBO60941 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DTNBO60941 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DTNBO60941 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DTNBO60941 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DTNBO60941 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DTNBO60941 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DTNBO60941 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DTNBO60941 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DTNBO60941 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DTNBO60941 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DTNBO60941 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DTNBO60941 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DTNBO60941 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DTNBO60941 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DTNBO60941 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DTNBO60941 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DTNBO60941 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DTNBO60941 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DTNBO60941 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DTNBO60941 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DTNBO60941 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DTNBO60941 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DTNBO60941 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DTNBO60941 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DTNBO60941 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DTNBO60941 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DTNBO60941 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DTNBO60941 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DTNBO60941 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DTNBO60941 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DTNBO60941 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DTNBO60941 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DTNBO60941 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DTNBO60941 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DTNBO60941 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DTNBO60941 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DTNBO60941 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DTNBO60941 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DTNBO60941 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DTNBO60941 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DTNBO60941 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DTNBO60941 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DTNBO60941 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DTNBO60941 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DTNBO60941 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DTNBO60941 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DTNBO60941 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DTNBO60941 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DTNBO60941 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DTNBO60941 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DTNBO60941 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DTNBO60941 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DTNBO60941 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DTNBO60941 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DTNBO60941 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DTNBO60941 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DTNBO60941 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DTNBO60941 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DTNBO60941 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DTNBO60941 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DTNBO60941 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DTNBO60941 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DTNBO60941 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DTNBO60941 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DTNBO60941 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DTNBO60941 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DTNBO60941 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DTNBO60941 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DTNBO60941 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DTNBO60941 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DTNBO60941 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTNBO60941 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTNBO60941 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTNBO60941 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTNBO60941 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTNBO60941 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTNBO60941 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTNBO60941 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DTNBO60941 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTNBO60941 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTNBO60941 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTNBO60941 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DTNBO60941 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DTNBO60941 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DTNBO60941 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DTNBO60941 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DTNBO60941 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DTNBO60941 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DTNBO60941 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DTNBO60941 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DTNBO60941 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DTNBO60941 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DTNBO60941 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms