Protein–RNA interactions for Protein: O60676

CST8, Cystatin-8, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST8O60676 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CST8O60676 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CST8O60676 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CST8O60676 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CST8O60676 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CST8O60676 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CST8O60676 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CST8O60676 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CST8O60676 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CST8O60676 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CST8O60676 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CST8O60676 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CST8O60676 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CST8O60676 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CST8O60676 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CST8O60676 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CST8O60676 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CST8O60676 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CST8O60676 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CST8O60676 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CST8O60676 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CST8O60676 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CST8O60676 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CST8O60676 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CST8O60676 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CST8O60676 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CST8O60676 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CST8O60676 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CST8O60676 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CST8O60676 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CST8O60676 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CST8O60676 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CST8O60676 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CST8O60676 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CST8O60676 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CST8O60676 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CST8O60676 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CST8O60676 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CST8O60676 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CST8O60676 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CST8O60676 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CST8O60676 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CST8O60676 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CST8O60676 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CST8O60676 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CST8O60676 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CST8O60676 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CST8O60676 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CST8O60676 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CST8O60676 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CST8O60676 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CST8O60676 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CST8O60676 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CST8O60676 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CST8O60676 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CST8O60676 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CST8O60676 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CST8O60676 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CST8O60676 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CST8O60676 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CST8O60676 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CST8O60676 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CST8O60676 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CST8O60676 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CST8O60676 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CST8O60676 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CST8O60676 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CST8O60676 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CST8O60676 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CST8O60676 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CST8O60676 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CST8O60676 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CST8O60676 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CST8O60676 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CST8O60676 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CST8O60676 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CST8O60676 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CST8O60676 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CST8O60676 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CST8O60676 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CST8O60676 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CST8O60676 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CST8O60676 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CST8O60676 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CST8O60676 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CST8O60676 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CST8O60676 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CST8O60676 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CST8O60676 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CST8O60676 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CST8O60676 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CST8O60676 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CST8O60676 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CST8O60676 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CST8O60676 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CST8O60676 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CST8O60676 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CST8O60676 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CST8O60676 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CST8O60676 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms