Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL41O60662 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms