Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD2O60548 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms