Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUDT21O43809 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms