Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITM2AO43736 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITM2AO43736 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms