Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLX3O43711 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLX3O43711 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLX3O43711 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLX3O43711 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLX3O43711 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLX3O43711 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TLX3O43711 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLX3O43711 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLX3O43711 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLX3O43711 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLX3O43711 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLX3O43711 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLX3O43711 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLX3O43711 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLX3O43711 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLX3O43711 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLX3O43711 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLX3O43711 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLX3O43711 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLX3O43711 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLX3O43711 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLX3O43711 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLX3O43711 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLX3O43711 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLX3O43711 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TLX3O43711 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLX3O43711 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TLX3O43711 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLX3O43711 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLX3O43711 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLX3O43711 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TLX3O43711 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLX3O43711 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLX3O43711 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLX3O43711 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLX3O43711 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLX3O43711 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLX3O43711 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLX3O43711 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLX3O43711 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLX3O43711 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLX3O43711 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLX3O43711 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLX3O43711 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLX3O43711 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLX3O43711 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLX3O43711 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLX3O43711 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLX3O43711 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TLX3O43711 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TLX3O43711 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TLX3O43711 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLX3O43711 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TLX3O43711 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLX3O43711 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLX3O43711 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLX3O43711 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLX3O43711 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLX3O43711 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLX3O43711 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLX3O43711 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLX3O43711 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLX3O43711 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLX3O43711 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLX3O43711 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLX3O43711 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLX3O43711 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLX3O43711 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLX3O43711 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLX3O43711 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLX3O43711 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLX3O43711 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLX3O43711 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLX3O43711 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLX3O43711 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLX3O43711 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLX3O43711 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLX3O43711 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLX3O43711 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLX3O43711 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLX3O43711 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLX3O43711 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLX3O43711 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLX3O43711 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TLX3O43711 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TLX3O43711 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLX3O43711 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLX3O43711 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLX3O43711 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLX3O43711 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLX3O43711 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLX3O43711 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLX3O43711 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLX3O43711 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TLX3O43711 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLX3O43711 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLX3O43711 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TLX3O43711 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLX3O43711 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms