Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TIMM44O43615 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMM44O43615 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms