Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSTPIP1O43586 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms