Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRS3O43559 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRS3O43559 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRS3O43559 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRS3O43559 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRS3O43559 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRS3O43559 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRS3O43559 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRS3O43559 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRS3O43559 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRS3O43559 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRS3O43559 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRS3O43559 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRS3O43559 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRS3O43559 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRS3O43559 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FRS3O43559 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRS3O43559 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRS3O43559 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRS3O43559 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRS3O43559 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRS3O43559 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRS3O43559 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRS3O43559 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRS3O43559 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRS3O43559 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRS3O43559 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRS3O43559 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRS3O43559 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRS3O43559 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRS3O43559 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRS3O43559 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRS3O43559 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRS3O43559 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRS3O43559 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRS3O43559 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRS3O43559 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRS3O43559 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRS3O43559 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRS3O43559 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRS3O43559 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRS3O43559 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRS3O43559 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRS3O43559 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRS3O43559 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRS3O43559 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRS3O43559 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRS3O43559 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRS3O43559 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRS3O43559 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRS3O43559 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRS3O43559 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRS3O43559 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRS3O43559 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRS3O43559 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRS3O43559 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRS3O43559 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRS3O43559 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRS3O43559 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRS3O43559 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRS3O43559 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRS3O43559 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FRS3O43559 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRS3O43559 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRS3O43559 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRS3O43559 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRS3O43559 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRS3O43559 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRS3O43559 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRS3O43559 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRS3O43559 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRS3O43559 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRS3O43559 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRS3O43559 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRS3O43559 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRS3O43559 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRS3O43559 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRS3O43559 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRS3O43559 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRS3O43559 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRS3O43559 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRS3O43559 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRS3O43559 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRS3O43559 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRS3O43559 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRS3O43559 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRS3O43559 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRS3O43559 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRS3O43559 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FRS3O43559 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRS3O43559 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRS3O43559 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRS3O43559 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRS3O43559 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRS3O43559 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRS3O43559 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRS3O43559 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRS3O43559 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRS3O43559 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRS3O43559 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms