Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHHO43323 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHHO43323 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHHO43323 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHHO43323 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHHO43323 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHHO43323 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHHO43323 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHHO43323 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHHO43323 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DHHO43323 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHHO43323 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DHHO43323 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHHO43323 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHHO43323 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHHO43323 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHHO43323 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DHHO43323 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHHO43323 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHHO43323 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHHO43323 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHHO43323 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHHO43323 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHHO43323 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHHO43323 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHHO43323 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHHO43323 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHHO43323 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DHHO43323 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHHO43323 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHHO43323 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHHO43323 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHHO43323 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHHO43323 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHHO43323 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHHO43323 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHHO43323 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHHO43323 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHHO43323 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHHO43323 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHHO43323 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DHHO43323 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DHHO43323 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHHO43323 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DHHO43323 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DHHO43323 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DHHO43323 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DHHO43323 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DHHO43323 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DHHO43323 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DHHO43323 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DHHO43323 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DHHO43323 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DHHO43323 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DHHO43323 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DHHO43323 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DHHO43323 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DHHO43323 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DHHO43323 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DHHO43323 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DHHO43323 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DHHO43323 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DHHO43323 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DHHO43323 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DHHO43323 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DHHO43323 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DHHO43323 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DHHO43323 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DHHO43323 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DHHO43323 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DHHO43323 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DHHO43323 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DHHO43323 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DHHO43323 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DHHO43323 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DHHO43323 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DHHO43323 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DHHO43323 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DHHO43323 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DHHO43323 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DHHO43323 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHHO43323 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHHO43323 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
DHHO43323 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHHO43323 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHHO43323 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHHO43323 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHHO43323 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHHO43323 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHHO43323 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DHHO43323 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHHO43323 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DHHO43323 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHHO43323 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHHO43323 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHHO43323 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DHHO43323 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHHO43323 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHHO43323 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHHO43323 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms