Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATMINO43313 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATMINO43313 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATMINO43313 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATMINO43313 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATMINO43313 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATMINO43313 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATMINO43313 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATMINO43313 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATMINO43313 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATMINO43313 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATMINO43313 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATMINO43313 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATMINO43313 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATMINO43313 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATMINO43313 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATMINO43313 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATMINO43313 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATMINO43313 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATMINO43313 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATMINO43313 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATMINO43313 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATMINO43313 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATMINO43313 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATMINO43313 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATMINO43313 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATMINO43313 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATMINO43313 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATMINO43313 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATMINO43313 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATMINO43313 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATMINO43313 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATMINO43313 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATMINO43313 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATMINO43313 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATMINO43313 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATMINO43313 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATMINO43313 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATMINO43313 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATMINO43313 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATMINO43313 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATMINO43313 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATMINO43313 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATMINO43313 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATMINO43313 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATMINO43313 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATMINO43313 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATMINO43313 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATMINO43313 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATMINO43313 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATMINO43313 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATMINO43313 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATMINO43313 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATMINO43313 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATMINO43313 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATMINO43313 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATMINO43313 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATMINO43313 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATMINO43313 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATMINO43313 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATMINO43313 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATMINO43313 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATMINO43313 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATMINO43313 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATMINO43313 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATMINO43313 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATMINO43313 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATMINO43313 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATMINO43313 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATMINO43313 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATMINO43313 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATMINO43313 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATMINO43313 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATMINO43313 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATMINO43313 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATMINO43313 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATMINO43313 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATMINO43313 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATMINO43313 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATMINO43313 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATMINO43313 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATMINO43313 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATMINO43313 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATMINO43313 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATMINO43313 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATMINO43313 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATMINO43313 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATMINO43313 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATMINO43313 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATMINO43313 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATMINO43313 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATMINO43313 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATMINO43313 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATMINO43313 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATMINO43313 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATMINO43313 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATMINO43313 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATMINO43313 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATMINO43313 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATMINO43313 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
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