Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNN4O15554 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNN4O15554 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNN4O15554 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNN4O15554 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNN4O15554 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNN4O15554 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNN4O15554 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms