Protein–RNA interactions for Protein: O14709

ZNF197, Zinc finger protein 197, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF197O14709 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF197O14709 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF197O14709 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF197O14709 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms