Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2CO00762 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2CO00762 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2CO00762 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2CO00762 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE2CO00762 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE2CO00762 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE2CO00762 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE2CO00762 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2CO00762 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2CO00762 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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