Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGRPO00253 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGRPO00253 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGRPO00253 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGRPO00253 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGRPO00253 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGRPO00253 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGRPO00253 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AGRPO00253 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGRPO00253 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGRPO00253 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGRPO00253 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGRPO00253 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGRPO00253 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGRPO00253 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGRPO00253 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGRPO00253 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGRPO00253 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGRPO00253 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGRPO00253 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGRPO00253 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGRPO00253 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGRPO00253 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGRPO00253 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGRPO00253 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AGRPO00253 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGRPO00253 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGRPO00253 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGRPO00253 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGRPO00253 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGRPO00253 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGRPO00253 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGRPO00253 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGRPO00253 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGRPO00253 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGRPO00253 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGRPO00253 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGRPO00253 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGRPO00253 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGRPO00253 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGRPO00253 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGRPO00253 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGRPO00253 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AGRPO00253 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGRPO00253 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGRPO00253 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGRPO00253 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGRPO00253 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGRPO00253 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGRPO00253 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGRPO00253 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGRPO00253 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGRPO00253 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGRPO00253 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGRPO00253 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGRPO00253 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGRPO00253 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGRPO00253 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGRPO00253 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGRPO00253 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGRPO00253 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGRPO00253 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGRPO00253 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGRPO00253 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGRPO00253 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGRPO00253 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGRPO00253 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGRPO00253 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGRPO00253 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AGRPO00253 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGRPO00253 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGRPO00253 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGRPO00253 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGRPO00253 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGRPO00253 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGRPO00253 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGRPO00253 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGRPO00253 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGRPO00253 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGRPO00253 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGRPO00253 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGRPO00253 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGRPO00253 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGRPO00253 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGRPO00253 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGRPO00253 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGRPO00253 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGRPO00253 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AGRPO00253 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGRPO00253 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGRPO00253 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGRPO00253 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGRPO00253 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGRPO00253 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGRPO00253 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGRPO00253 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGRPO00253 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGRPO00253 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGRPO00253 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGRPO00253 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms