Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF10AO00220 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF10AO00220 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms