Protein–RNA interactions for Protein: H3BQB6

STMND1, Stathmin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMND1H3BQB6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMND1H3BQB6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STMND1H3BQB6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMND1H3BQB6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms