Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRN3E7EW58 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRN3E7EW58 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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