Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PROB1E7EW31 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROB1E7EW31 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PROB1E7EW31 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.5 ms