Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2CD4DB7Z1M9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2CD4DB7Z1M9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2CD4DB7Z1M9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2CD4DB7Z1M9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2CD4DB7Z1M9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2CD4DB7Z1M9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C2CD4DB7Z1M9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C2CD4DB7Z1M9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms