Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDR42E2A6NKP2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms