Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85CA6NKD9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC85CA6NKD9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85CA6NKD9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms