Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TVP23AA6NH52 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms