Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A6NDN8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A6NDN8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A6NDN8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A6NDN8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A6NDN8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A6NDN8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A6NDN8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A6NDN8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A6NDN8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A6NDN8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A6NDN8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A6NDN8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A6NDN8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A6NDN8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A6NDN8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A6NDN8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A6NDN8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A6NDN8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A6NDN8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A6NDN8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A6NDN8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A6NDN8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A6NDN8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A6NDN8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A6NDN8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A6NDN8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A6NDN8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A6NDN8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A6NDN8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A6NDN8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A6NDN8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A6NDN8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A6NDN8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A6NDN8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A6NDN8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A6NDN8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A6NDN8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A6NDN8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A6NDN8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A6NDN8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A6NDN8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A6NDN8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A6NDN8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A6NDN8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A6NDN8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A6NDN8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A6NDN8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A6NDN8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A6NDN8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A6NDN8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A6NDN8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A6NDN8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A6NDN8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A6NDN8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A6NDN8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A6NDN8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A6NDN8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A6NDN8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A6NDN8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A6NDN8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A6NDN8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A6NDN8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A6NDN8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A6NDN8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A6NDN8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A6NDN8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NDN8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A6NDN8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NDN8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A6NDN8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A6NDN8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A6NDN8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NDN8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NDN8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NDN8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NDN8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NDN8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NDN8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NDN8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NDN8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NDN8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NDN8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NDN8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NDN8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NDN8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NDN8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NDN8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NDN8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NDN8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NDN8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NDN8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NDN8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NDN8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NDN8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NDN8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NDN8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NDN8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A6NDN8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A6NDN8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms