Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0J9YYE9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0J9YYE9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0J9YYE9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms