Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PARP3Q9Y6F1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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