Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms