Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX2

MYH2, Myosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH2Q9UKX2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYH2Q9UKX2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms