Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms