Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms