Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms