Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms